@jlb
Merci pour ta réponse qui m'a fait réfléchir et découvrir une bizarrerie.
J'ai commencé par cliquer droit sur le fichier à ouvrir

et ai appuyé sur "Entrée" pour lancer le dit fichier. Résultat : comme avant me demande un type de diagramme.
J'ai ensuite passé à la ligne suivante et demandé "Ouvrir avec une application"

et je m'aperçois avec horreur qu'il y a deux applications "LibreOffice Calc" avec chacune une icône légèrement différente !
J'ai ensuite fait comme tu me l'as demandé, j'ai cliqué droit et ai choisi "Propriétés"

Je vois encore une application "LibreOffice Calc" par défaut et une autre "Recommandée"
Je choisis la "Recommandée" et la définit "Par défaut"
Avec la seconde application "LibreOffice Calc" le fichier s'ouvre normalement et les autres aussi
Donc problème à priori résolu, puisque désormais je ne me vois plus proposer la boîte de dialogue "Diagrames", MAIS, je me trouve avec une application - ou un résidu d'application - qui encombre mon OS !
J'avais désinstallé la version précédente de LibreOffice qui ne voulait pas "Enregistrer sous" le même nom; c'est probablement un reste ?
Comment faire pour nettoyer le tout ?
Désinstaller à nouveau et faire un nettoyage quelconque ? Avec quelle lessive

?
Bon j'ai avancé mais j'aimerais garder une installation la plus propre possible (même si le ménage n'est pas mon fort

) ?